«Ce n'est pas parti.  Ça change.  Ça tue' : les variantes du COVID que l'OMS surveille de près

Jean Delaunay

«Ce n’est pas parti. Ça change. Ça tue’ : les variantes du COVID que l’OMS surveille de près

Il existe plusieurs sous-variantes d’Omicron en circulation dans le monde. Mais de quoi s’agit-il et pourquoi ne nous en préoccupons-nous pas autant que les responsables de l’OMS ?

Même si le pic de la pandémie est peut-être passé, le virus à l’origine de la COVID-19 continue de muter et de multiples variantes circulent dans chaque pays.

Pourtant, malgré cela, les tests et la surveillance ont diminué, les experts exhortant les gens à continuer de prendre au sérieux la menace de cette maladie.

« Le monde a évolué depuis le COVID, et à bien des égards, c’est bien parce que les gens sont capables de rester protégés et de se protéger, mais ce virus n’est allé nulle part. Il circule. Il change, il tue, et nous devons continuer. « , a déclaré Maria Van Kerkhove, responsable technique du COVID-19 à l’Organisation mondiale de la santé (OMS), à L’Observatoire de l’Europe Next.

Quelles sont les variantes du COVID les plus courantes aujourd’hui ?

Tous les variants qui circulent aujourd’hui sont des sous-lignées d’Omicron, un variant hautement transmissible du COVID-19 apparu pour la première fois il y a deux ans.

Une sous-lignée, EG.5, également surnommée Eris, représente actuellement plus de la moitié des variantes du COVID-19 circulant dans le monde. Il a été déclaré comme variante intéressante par l’OMS en août.

Les cas d’EG.5 ont augmenté au cours de l’été, mais ils ont récemment été dépassés aux États-Unis par une sous-variante étroitement apparentée appelée HV.1. Cette sous-variante représente désormais 29 % des cas de COVID-19 aux États-Unis, selon les derniers chiffres des Centers for Disease Control and Prevention (CDC).

« HV.1 est essentiellement une variante dérivée de EG.5.1 (et auparavant de XBB.1.5) qui accumule simplement quelques mutations qui lui permettent de mieux infecter les personnes immunisées contre le SRAS-CoV-2 », a déclaré Andrew Pekosz, professeur. de microbiologie moléculaire et d’immunologie à l’Université Johns Hopkins aux États-Unis, a déclaré à L’Observatoire de l’Europe Next.

Pekosz, qui étudie la réplication des virus respiratoires, a déclaré que ces variantes sont probablement apparues comme des mutations aléatoires dans le cadre de l’évolution naturelle des virus.

Selon les Centres européens de contrôle et de prévention des maladies (ECDC), les variantes de type XBB 1.5 telles que EG.5 – ou Eris – sont actuellement dominantes, représentant environ 67 % des cas dans les pays de l’UE/EEE.

Un assistant de laboratoire utilise une pipette pour préparer l’ARN du coronavirus pour le séquençage au Wellcome Sanger Institute de Cambridge, 2021.
Un assistant de laboratoire utilise une pipette pour préparer l’ARN du coronavirus pour le séquençage au Wellcome Sanger Institute de Cambridge, 2021.

La prévalence d’une autre sous-lignée d’Omicron appelée BA.2.86 « augmente lentement à l’échelle mondiale », selon l’OMS, qui l’a récemment classée comme « variante d’intérêt ». Ses séquences ont été signalées pour la première fois en Israël et au Danemark en juillet et août.

« BA.2.86, lorsqu’il est apparu, était quelque chose de vraiment préoccupant pour les scientifiques car il s’agissait d’une variante qui présentait un grand nombre de mutations, en particulier dans la protéine de pointe, qui est la cible de l’immunité protectrice que vous confèrent les vaccins et les infections. « , a déclaré Pekosz.

Les scientifiques pensent que cette variante est probablement originaire d’une personne dont le système immunitaire est affaibli, ce qui a permis au virus de se répliquer et d’accumuler des mutations à un rythme plus rapide, mais elle est loin de devenir dominante.

Les autorités françaises ont cependant récemment déclaré que la plupart des cas de BA.2.86 dans le pays étaient une nouvelle sous-lignée JN.1, qui a été « détectée dans d’autres pays mais qui circule principalement en Europe et particulièrement en France ».

Il semble y avoir davantage de mutations qui le rendent plus transmissible, a déclaré Pekosz.

Faut-il s’inquiéter des nouveaux variants du COVID ?

Les virus à ARN comme le SRAS-CoV-2, qui cause le COVID-19, sont connus pour détecter des mutations à un rythme plus rapide que les autres virus « parce qu’ils font plus d’erreurs et n’ont pas la capacité de corriger ces erreurs », selon Pekosz. .

Le SRAS-CoV-2 et sa protéine Spike semblent également tolérer de nombreuses mutations, similaires à ce que les scientifiques observent avec la grippe.

Mais jusqu’à présent, même si les scientifiques s’intéressent à ces mutations, ils ne constatent aucun changement dans la gravité de la maladie, et les tests que nous utilisons continuent de détecter le virus.

Ces nouveaux variants continueront d’apparaître et « pour les personnes les plus fragiles de la société, en particulier celles souffrant de certains problèmes de santé sous-jacents, ils continueront de contribuer aux hospitalisations et même aux décès », a déclaré Andrew Pollard, professeur d’infection et d’immunité à l’Université de Washington. Oxford.

Cependant, Pollard ne s’attend pas à ce qu’ils « relancent une pandémie », car à l’échelle mondiale, il existe une forte immunité de la population contre la vaccination et les infections antérieures.

Même si de nouvelles familles de COVID-19 sont « probablement générées par mutation », il n’y en a pas eu « avec autant de succès que les variantes Omicron qui dominent », a-t-il déclaré. « Du moins pour le moment ».

Une femme reçoit le vaccin Moderna COVID-19 à Madrid, Espagne, 2021.
Une femme reçoit le vaccin Moderna COVID-19 à Madrid, Espagne, 2021.

Le pire des cas serait une nouvelle variante qui se propagerait plus rapidement et provoquerait des maladies plus graves contre lesquelles les vaccins ne fonctionnent pas.

« Nous ne tenons rien pour acquis. Nous prévoyons différents scénarios en termes de variantes et de détection », a déclaré Van Kerkhove, qui est également directeur par intérim de l’OMS pour la préparation et la prévention des épidémies et des pandémies.

La diminution des tests et de la surveillance est « un défi »

Pour le moment, ces variantes ne provoquent pas de nouvelle augmentation importante des cas ou des hospitalisations, et même si les experts affirment qu’il existe encore suffisamment de séquençage pour détecter les variantes émergentes, ces efforts ont diminué.

« Ce que nous avons perdu récemment, c’est la capacité d’avoir une idée réelle de toute la diversité présente dans ces populations virales », a déclaré Pekosz.

Van Kerkhove a encouragé les gens à continuer de se faire tester s’ils pensent avoir le COVID-19, car cela permet aux scientifiques de suivre le virus et de le séquencer ultérieurement pour étudier d’éventuelles mutations.

« Si vous n’êtes pas testé, vous ne pouvez pas être séquencé », a-t-elle déclaré.

La réduction des tests et du séquençage ainsi que l’augmentation des délais dans l’obtention des données « sont très difficiles pour nous et ralentissent notre capacité à évaluer les risques de chacune de ces sous-variantes », a-t-elle ajouté.

Plus important encore, alors même que le monde évolue, les experts recommandent aux gens de se faire vacciner, de porter des masques dans les foules ou à proximité de personnes présentant un risque plus élevé de contracter une forme grave du COVID-19, et de se faire tester pour empêcher sa propagation.

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